肥厚型心肌病的病因与遗传有关。
肥厚型心肌病为常染色体显性遗传，具有遗传异质性，目前研究发现至少有18个疾病基因和500种以上变异与肥厚型心肌病有关。其中较为常见的是β-肌球蛋白重链及肌球蛋白结合蛋白C编码基因有关。因为肥厚型心肌病的表型呈多样性，发病原因除了与突变的基因、基因修饰以及不同的环境因子有关，也有很大一部分患者目前无法找到遗传原因。
肥厚型心肌病患者日常需要严格遵医嘱按时、按量用药，避免私自停药。
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