不同类型的短肠综合征病因也有所区别，具体如下：

　　一、成人短肠综合征

　　1.肠系膜上静脉血栓形成

　　患者发生肠系膜上静脉血栓形成的情况时，可造成其肠道血液循环出现障碍，肠黏膜缺血、坏死，从而引发短肠综合征的形成。

　　2.克罗恩病

　　患者的克罗恩病反复发作时，可造成其病变的肠道溃疡情况加重，将患者发生溃疡部位的肠道切除后，易引起短肠综合征。

　　3.肠癌

　　患者发生小肠癌的情况时，癌症可向其健康的肠道扩散，患者需要将存在癌细胞的肠道切除，控制病情进展，此时其也可能会发生短肠综合征。

　　二、儿童短肠综合征

　　1.先天性小肠闭锁

　　患者发生先天性小肠闭锁的情况时，食物无法顺利通过小肠排出体外，医生将患者闭锁的小肠切除后，可造成其肠道变短，进一步导致其发生短肠综合征的情况。

　　2.先天性肠旋转不良

　　患者存在先天性肠旋转不良的情况时，进食后易发生肠管堵塞的情况，可造成其肠管逐渐缩短，形成短肠综合征。

　　3.新生儿坏死性小肠结肠炎

　　肠道感染导致患者的小肠结肠发生坏死的情况时，医生可能会切除其坏死的肠管，使其肠管的长度变短，吸收的营养不足时，可发展成短肠综合征。