枕骨大孔疝的预防是注意保护头部、避免不当医源性操作、积极控制血管危险因素，具体如下：
1.注意保护头部
在骑车或是激烈的竞技运动下注意佩戴头盔，若是出现头部创伤的情况，需要及时到医院检查。
2.避免不当医源性操作
对于颅内压较高的患者避免腰椎穿刺的方式引流大量的脑脊液等行为，其可能不利于颅内压，容易出现身体异常的情况。
3.积极控制血管危险因素
生活中注意养成低糖低盐低脂的习惯，降低患有糖尿病、高血压、高血脂的病症，其可能会影响脑血管组织，增加出现枕骨大孔疝的可能性。
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