枕骨大孔疝的诊断方法是体格检查、影像学检查、实验室检查等，具体如下：
1.体格检查
医生会对于患者的头部、颈部做视诊和触诊，考虑颈部是否有压痛、活动受限等情况。
2.影像学检查
枕骨大孔疝的患者也可以做颅脑CT、MRI等，其可以较为清晰的显示颅后窝、脑干部位的病变，明确枕骨大孔疝的病因。
3.实验室检查
对于部分患者可以考虑做实验室方面的检查，其可以帮助排除感染、寄生虫、血液病等情况。
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