预防真菌性食管炎的方法有避免滥用药物、积极治疗相关疾病、注意个人卫生等。
1.避免滥用药物
健康人群在日常生活中应该正确使用药物，禁止滥用抗生素、激素类药物，以免引起菌群失调，真菌繁殖，引起疾病的发生。
2.积极治疗相关疾病
当机体患有食管、胃黏膜疾病时，应该及时治疗疾病，避免食管和胃黏膜损伤，预防真菌性食管炎的发生。
3.注意个人卫生
健康人群平时应严格注意个人卫生，勤刷牙、勤漱口，避免食用不洁的食物，有助于降低本病的患病率。
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