真菌性食管炎的治疗方法有一般治疗、药物治疗、手术治疗等。
1.一般治疗
患者患病期间应该注意口腔卫生，保持情绪稳定，避免过分紧张、焦虑，积极配合治疗后，可以促进病情恢复。
2.药物治疗
患者应该遵医嘱使用伏立康唑片、氟胞嘧啶片等药物，前者可以抑制麦角甾醇的生物合成，后者能够破坏菌体蛋白质合成，实现杀灭真菌的目的。
3.手术治疗
真菌感染导致患者出现严重的食管狭窄症状时，可以进行食管狭窄扩大术，扩张食管后，可以改善吞咽困难的症状。
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