通过直接镜检、血真菌培养、免疫学和分子生物学检测、组织病理学检查等方式可以诊断是否存在念珠菌病。
1、直接镜检
标本中发现有大量菌丝及成群芽孢时具有诊断意义。如果只在痰液或阴道分泌物中见到芽孢没有菌丝，可能是正常带菌状态，没有诊断意义。
2、血真菌培养
血培养报告念珠菌菌属阳性时是深部念珠菌感染的重要证据。
3、免疫学和分子生物学检测
酶联免疫吸附试验可以检测念珠菌抗原，有较好的早期诊断价值。
4、组织病理学检查
对病变组织进行活检发现有芽孢、假菌丝或真菌丝可以诊断为念珠菌病。
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