肠道菌群失调症的诊断方法是粪便检查、血液检查、内镜检查等，具体如下：
1.粪便检查
在临床上可以做大便隐血试验，其可以帮助明确是否有消化道出血等情况。
2.血液检查
肠道菌群失调症还需要做血液检查，如血常规、血液电解质检查等，其可以帮助其他疾病和肠道菌群失调症的鉴别。
3.内镜检查
在临床上也可以做内镜检查，如胃镜、结肠镜，其可以较为直接的观察到消化道是否出血、糜烂。
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