通过临床症状、组织病理学检查即可诊断扁平苔藓，还可以通过实验室检查进一步明确疾病类型。
1、临床症状
该病患者常见较为典型的皮肤和黏膜损伤，比如皮肤多处紫红色扁平丘疹、指甲变薄开裂、口腔黏膜和生殖器黏膜有白色网状条纹等。
2、组织病理学检查
取患者病变部位的一小块组织制成标本，通过显微镜观察标本内是否存在扁平苔藓细胞形态特征，如果存在即可确诊。
3、实验室检查
包括直接免疫荧光检查、丙型肝炎检查、过敏检查等，可用于发现疾病诱因，并进行疾病分型。
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