根据病情的轻重程度可将脑干脑炎分为轻度、中度和重度，病情的轻重程度不同，临床症状也有所不同，具体如下：
1、轻度和中度
患者发生轻度和中度脑干脑炎的情况时，其可能会出现发热、头痛、四肢肌肉酸痛、无力、恶心、呕吐、食欲下降等不适症状;部分患者皮肤表现还可能会出现点状血疹，按压后一般不褪色;脑干脑炎引发心肌炎时，患者还会出现胸闷、气短、心慌、下肢水肿等症状。
2、重度
患者发生重度脑炎时，可造成其神经功能损伤，患者此时可出现烦躁不安、嗜睡、复视、听力下降、意识障碍、昏迷等症状。
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