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诊断胆总管结石主要根据患者症状和体征，还有相关检查来确诊。
胆总管结石平时可能没有症状，但是引起了梗阻之后，会出现黄疸和腹痛。如果是结石梗阻非常彻底，引起急性化脓性胆管炎时，会出现典型症状，包括高烧、剧烈腹痛、深部黄染、巩膜黄染。
除了这些症状之外，还要依靠实验室检查，比如抽血中，肝功能中胆红素升高，以直接胆红素升高为主，尿和粪便当中胆原降低。
另外依靠影像学检查，比如B超、CT和磁共振都可以明确看到扩张胆管和胆管下段结石影。还有些有创检查，包括肝穿刺胆道造影、经内镜下胆管的逆行造影。
综合这些症状、体征和辅助检查，可以明确的诊断胆总管结石。
