良性脑肿瘤与恶性脑肿瘤在生长速度、细胞分化程度、对机体影响、影像学表现、治疗及预后方面存在差异，良性脑肿瘤生长缓慢、分化程度高、主要靠占位效应影响机体、影像学边界清、手术切除为主预后好；恶性脑肿瘤生长快、分化程度低、有占位效应和转移、影像学边界不清水肿重、需综合治疗预后差，儿童、性别、生活方式、脑部疾病史等对脑肿瘤良恶性有一定影响但非本质区别。
一、生长速度方面
良性脑肿瘤：生长较为缓慢，可能在数月甚至数年时间内体积才会有较明显变化。这是因为其细胞增殖相对有序，受周围组织限制等因素影响，扩张速度慢。例如一些脑膜瘤，可能在数年的影像学检查中才会观察到缓慢的体积增大。
恶性脑肿瘤：生长速度往往较快，短期内就可能有明显变化。像胶质母细胞瘤，肿瘤细胞增殖活跃，会在较短时间内占据更多脑部空间，导致病情迅速进展。这是由于恶性肿瘤细胞失去了正常的生长调控机制，无序增殖。
二、细胞分化程度方面
良性脑肿瘤：肿瘤细胞分化程度高，与正常脑组织细胞形态、功能相似。其细胞的形态、结构和功能接近正常细胞，所以对周围组织的侵袭性相对较弱。比如垂体腺瘤，瘤细胞在形态和功能上与正常垂体细胞有一定相似性，一般不会像恶性肿瘤那样广泛浸润周围组织。
恶性脑肿瘤：细胞分化程度低，与正常脑组织细胞差异大。肿瘤细胞形态不规则，功能异常，往往具有很强的侵袭性，容易向周围组织浸润生长，破坏正常脑组织结构和功能。例如神经母细胞瘤，瘤细胞分化差，与正常神经细胞相差甚远，很容易侵犯周围脑组织并转移。
三、对机体的影响方面
良性脑肿瘤：主要是通过占位效应引起症状。随着肿瘤体积增大，压迫周围脑组织、神经等结构，从而出现相应的临床表现，如头痛、癫痫、视力障碍等，但一般不会出现远处转移。不同部位的良性脑肿瘤会导致对应区域的功能障碍，例如听神经瘤会引起听力下降等症状。
恶性脑肿瘤：除了占位效应外，还容易发生转移，侵犯周围重要结构，病情进展迅速，对机体的危害极大。恶性脑肿瘤细胞可以通过脑脊液循环等途径转移到脑部其他部位或脊髓，并且会广泛破坏脑组织，导致患者出现严重的神经功能缺损、剧烈头痛、呕吐、意识障碍等，预后通常较差。
四、影像学表现方面
良性脑肿瘤：在影像学上边界清晰，多呈圆形或椭圆形，与周围脑组织分界清楚，一般周围水肿较轻。例如头颅MRI检查时，良性脑膜瘤往往表现为边界规整的占位病变，周围水肿带不明显。
恶性脑肿瘤：影像学上边界多不清楚，形态不规则，常呈浸润性生长，与周围脑组织分界模糊，并且周围水肿较为明显。像胶质母细胞瘤在MRI上常表现为边界不清、周围水肿严重的占位病灶，增强扫描时多有明显的不均匀强化。
五、治疗及预后方面
良性脑肿瘤：治疗以手术切除为主，多数情况下可以完整切除，术后复发概率相对较低，患者预后较好。例如大部分良性脑膜瘤通过手术完整切除后，患者可以长期生存，神经功能缺损等症状能得到较好改善。
恶性脑肿瘤：治疗相对复杂，手术难以完全切除干净，通常需要结合术后放疗、化疗等综合治疗手段，但复发率高，患者预后较差。例如胶质母细胞瘤，即使经过手术、放化疗等综合治疗，患者的生存期也较短，平均生存期可能在1-2年左右。
对于儿童患者，良性脑肿瘤如果能及时发现并手术切除，预后相对较好；而恶性脑肿瘤即使经过治疗，预后也往往不容乐观。女性和男性在脑肿瘤良恶性区别的表现上并没有本质差异，但不同性别的人群可能好发的脑肿瘤类型有一定差异，不过这不是良恶性的区别所在。有不良生活方式的人群可能因长期接触致癌因素等增加患恶性脑肿瘤的风险，但这也不是良恶性本身的区别。有脑部疾病病史的人群在发生脑肿瘤时，需要更仔细鉴别良恶性，因为基础疾病可能会影响影像学表现等判断。
