小儿支原体感染后可出现发热，多为中等度热或高热且持续时间较长，因刺激机体免疫系统致体温调节中枢功能紊乱引起；咳嗽为突出症状，多为刺激性干咳且持续时间长，因感染呼吸道致炎症反应刺激感受器引起，不同年龄小儿咳嗽表现有差异；还有呼吸系统外表现，部分患儿有皮疹、肌肉疼痛、消化道症状等，因全身免疫反应累及其他系统且不同年龄小儿表现不同；一般状况方面患儿可出现精神萎靡、食欲减退等，因感染致身体应激、能量消耗增加、机体功能受影响且不同年龄小儿状况改变程度不同。
小儿支原体感染后发热较为常见，多为中等度热，体温一般在38℃~39℃左右，也有部分患儿可出现高热，体温可达39℃以上。发热可持续较长时间，有的患儿发热会持续1~3周不等。这是因为支原体感染人体后，会刺激机体免疫系统产生炎症反应，从而导致体温调节中枢功能紊乱引起发热。不同年龄的小儿对发热的耐受程度不同，婴幼儿可能因发热出现哭闹不安、食欲减退等表现，而年长儿可能会诉说畏寒等症状。
咳嗽
咳嗽是小儿支原体感染的另一突出症状，多为刺激性干咳，咳嗽较为剧烈，有时可呈痉挛性咳嗽。咳嗽可持续较长时间，有的患儿咳嗽会持续数周甚至数月。这是由于支原体感染呼吸道后，附着在呼吸道黏膜上，引起呼吸道炎症反应，刺激呼吸道感受器导致咳嗽。对于不同年龄的小儿，咳嗽表现可能有所差异，婴幼儿咳嗽可能不典型，常表现为喘息等，而年长儿咳嗽相对更典型为干咳。
其他症状
呼吸系统外表现：部分患儿可能出现皮疹，皮疹多为多形性，如红斑、斑丘疹等；有的患儿可能出现肌肉疼痛，尤其是大腿、小腿等部位的肌肉；还可能出现消化道症状，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等，但相对较少见。这些呼吸系统外表现是因为支原体感染后，除了引起呼吸道炎症，还可能引发全身免疫反应，累及其他系统。不同年龄小儿的呼吸系统外表现可能不同，婴幼儿由于免疫系统和各器官发育尚未完善，出现呼吸系统外表现时可能症状相对不典型，需要更仔细观察。
一般状况：患儿可能出现精神萎靡、食欲减退等情况。年龄较小的患儿可能会比平时更嗜睡，活动量明显减少；年长儿可能会诉说乏力，不愿意进行日常的学习或玩耍等活动。这是因为感染导致身体处于应激状态，能量消耗增加，机体功能受到影响所致。不同年龄小儿的一般状况改变程度也有所不同，婴幼儿可能表现得更为明显和直接，而年长儿可能能表达出自身的不适感受但相对婴幼儿来说可能症状相对轻一些。
