健梢囊肿有诸多危害，在局部会致不适与功能受限，影响外观、活动且可致疼痛；对关节健康有潜在影响，可损伤关节软骨、改变关节稳定性；对特殊人群也有特殊危害，儿童患者会影响手部正常发育，老年患者会加重关节负担加速关节退变降低生活质量。
影响外观与活动：健梢囊肿通常好发于手部关节等部位，若长在手部显眼位置，会影响外观美观。比如长在手指关节处，可能会使手指活动时受到阻碍，影响日常的精细动作，像拿筷子、写字等，对于从事需要精细操作工作的人群，会严重影响工作效率。从病理角度看，囊肿会占据局部空间，导致关节周围组织受到挤压，进而限制关节的正常活动范围，长期如此可能会引起关节活动度下降。
疼痛不适：部分患者会出现疼痛症状，尤其是在活动囊肿所在关节时，疼痛可能会加剧。这是因为囊肿对周围的神经、血管等组织产生刺激，炎症反应也可能导致局部疼痛。疼痛会影响患者的日常生活质量，使患者在休息或活动时都可能感受到不适，进而影响睡眠等。
对关节健康的潜在影响
关节软骨损伤风险：长期存在的健梢囊肿如果没有得到及时处理，囊肿持续对关节周围结构产生压力，可能会间接影响关节软骨的营养供应和正常代谢。关节软骨是关节缓冲和运动的重要结构，软骨受损可能会加速关节退变，增加患骨关节炎的风险。研究表明，关节周围长期受肿物压迫的情况下，软骨细胞的代谢会发生异常，导致软骨基质破坏，进而影响关节的正常功能。
关节稳定性改变：健梢囊肿所在部位的关节稳定性可能会受到影响。囊肿的存在会改变关节周围的力学结构，使得关节在活动时受力不均匀，长期下来可能导致关节稳定性下降，更容易发生关节扭伤等情况，而且也会使关节退变的进程加快，影响关节的长期健康。
对特殊人群的特殊危害
儿童患者：儿童手部的健梢囊肿可能会影响手部的正常发育。儿童处于生长发育阶段，手部的关节和组织还在不断生长，如果囊肿影响了关节的正常活动和发育环境，可能会导致手指的生长发育出现异常，比如手指的长度、粗细等与正常侧存在差异，同时也会影响手部精细动作的发育，对儿童未来的生活和学习产生不利影响。由于儿童表达能力有限，家长需要更加密切关注儿童手部囊肿的情况，一旦发现应及时就医。
老年患者：老年患者本身关节退变的基础情况相对较重，健梢囊肿会进一步加重关节的负担。老年患者的关节软骨已经有一定程度的磨损，健梢囊肿引起的关节活动受限和力学改变会加速关节软骨的退变，从而使骨关节炎的症状更早出现且更加严重，影响老年患者的行走、日常活动能力等，降低老年患者的生活自理能力和生活质量。老年患者的身体机能相对较弱，恢复能力也不如年轻人，所以对于老年患者的健梢囊肿更要重视及时处理。
