不同部位的错构瘤症状也会存在差异，如下丘脑神经元错构瘤、肾错构瘤、肺错构瘤等。
1、下丘脑神经元错构瘤
患者主要表现为青春期前性早熟、痴笑性癫痫以及其他类型癫痫、行为异常等。
2、肾错构瘤
临床表现与肿瘤大小密切相关，较小的肾错构瘤一般没有明显症状，肿瘤较大时会有突发性剧痛、血压下降、肉眼血尿等表现。
3、肺错构瘤
一般体检时发现，无明显症状，较大的肺错构瘤压迫支气管时会引起咳嗽、咳痰、咯血、气短等情况，若是侵犯胸膜，还会伴有胸部疼痛。
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