阵发性睡眠性血红蛋白尿的鉴别诊断需重点区分获得性溶血性贫血、再生障碍性贫血、遗传性红细胞膜病、其他血红蛋白尿及骨髓增生异常综合征等。
与免疫性溶血性贫血（AIHA）鉴别
AIHA以自身抗体介导红细胞破坏为主，Coombs试验阳性为核心特征，而PNH补体系统异常，Coombs试验阴性；PNH患者红细胞表面CD55/CD59表达缺失，AIHA无此免疫表型异常；AIHA常伴自身免疫疾病（如系统性红斑狼疮），PNH无明确自身免疫背景。
与再生障碍性贫血（AA）鉴别
PNH可表现为全血细胞减少，但骨髓造血功能多呈活跃或亢进状态；AA以骨髓增生低下为特征，造血细胞显著减少；PNH患者典型血红蛋白尿及含铁血黄素尿是重要线索，AA无此类血管内溶血证据；流式细胞术检测CD55/CD59缺失克隆细胞可明确PNH诊断。
与遗传性球形红细胞增多症（HS）鉴别
HS为常染色体显性遗传性红细胞膜病，PNH为获得性克隆性疾病；HS以球形红细胞增多为特征，酸化甘油溶血试验阳性，Coombs试验阴性；PNH无典型球形红细胞形态，蔗糖溶血试验或Ham试验阳性；儿童HS多有家族史，PNH无家族遗传背景。
与其他血红蛋白尿鉴别
行军性血红蛋白尿多因剧烈运动后短暂出现，无PNH克隆细胞，实验室检查无CD55/CD59缺失；阵发性冷性血红蛋白尿（PCH）由Donath-Landsteiner抗体介导，寒冷环境下发作，Ham试验阴性，与PNH的补体介导溶血机制不同；上述疾病均无PNH克隆细胞特征。
与骨髓增生异常综合征（MDS）鉴别
MDS以病态造血为核心，骨髓活检可见原始细胞增多及幼稚细胞定位异常；PNH无髓系病态造血，以克隆性CD55/CD59缺失为特征；MDS染色体核型异常发生率高，PNH克隆细胞比例可随病情波动；MDS无PNH典型的血管内溶血表现（如血红蛋白尿）。
（注：鉴别诊断需结合流式细胞术检测CD55/CD59缺失、骨髓造血功能评估及家族史综合判断，特殊人群如老年患者、儿童或孕妇需注意溶血诱因与克隆细胞活性差异。）
