牙根尖囊肿通常不能自愈，其由根尖周组织炎症致上皮剩余增殖形成，不治疗会随时间增大，引发牙槽骨吸收等不良后果，儿童和成年患者若不及时处理，病变都难自行恢复，需积极就医治疗。
一、发病机制角度分析
根尖周组织长期受到感染刺激，如龋齿、牙髓感染未得到及时治疗等，炎症持续作用使得根尖周的上皮性细胞剩余发生增殖，逐渐形成囊肿样结构。这种病理性的结构不会自行消退，而是会随着时间推移逐渐增大。例如，有研究表明，长期存在的牙髓感染引发的根尖周病变，会不断刺激根尖周组织的上皮成分，促使囊肿持续发展。
二、临床转归方面
在临床上，一旦确诊为牙根尖囊肿，若不进行治疗，囊肿会逐渐增大，可能会引起一系列不良后果。比如，囊肿增大可能会压迫周围的牙槽骨，导致牙槽骨吸收，影响牙齿的稳固性；还可能突破骨皮质向周围软组织扩展，引起局部肿胀、疼痛等不适症状，而且这种病变不会自然恢复，反而会不断进展加重病情。
三、特殊人群情况考虑
儿童患者：儿童若患有牙根尖囊肿，由于儿童处于生长发育阶段，囊肿的存在可能会影响牙齿的正常发育和牙槽骨的生长。如果不及时处理，可能会导致恒牙萌出异常等问题。因此，对于儿童牙根尖囊肿更需要积极干预，因为儿童自身机体的修复难以使囊肿自愈，反而病变可能会随着儿童的生长发育而产生更严重的影响。
成年患者：成年患者的根尖周组织已经相对稳定，但牙根尖囊肿也不会自行消退。成年患者若不治疗，囊肿可能会持续影响根尖周组织，导致牙齿周围的骨质进一步破坏，甚至可能影响相邻牙齿的健康。而且随着年龄增长，机体的修复能力相对减弱，病变更难自行恢复，所以成年患者也需要及时就医进行相应治疗。
