遗传性多发性骨软骨瘤多数预后较好，少数因并发症或恶变预后差；儿童及青少年时期肿瘤随骨骼生长可能增大，需密切监测，成年后骨骼停止生长但若有不可逆损害会影响生活；性别对预后影响不大；合理生活方式有利预后，不良生活方式不利；既往治疗史和家族病史会间接影响预后。
多数预后较好：遗传性多发性骨软骨瘤是一种常染色体显性遗传病，多数患者的病情进展相对缓慢，在儿童和青少年时期发病，随着骨骼的生长，肿瘤会逐渐生长，但多数情况下不会发生恶变，对患者的生存时间影响较小。例如，大部分患者可以正常生活、工作，寿命与正常人无异。
少数可能出现不良预后：少数患者可能会出现一些并发症影响预后。比如，肿瘤生长可能会压迫周围的神经、血管或肌腱等结构，导致疼痛、肢体活动受限等症状。如果肿瘤发生恶变，转变为软骨肉瘤，预后则会变差，患者的生存时间和生活质量都会受到严重影响。据相关研究统计，遗传性多发性骨软骨瘤发生恶变的概率约为1%-5%左右，但一旦恶变，预后明显不佳。
不同年龄阶段的预后差异
儿童及青少年时期：此阶段骨骼处于生长发育阶段，肿瘤可能会随着骨骼生长而增大。但如果能及时发现并采取合适的监测措施，多数患者在这个时期通过密切观察肿瘤的生长速度、是否出现压迫症状等情况，可及时处理可能出现的问题。例如，定期进行影像学检查（如X线、CT等）来评估肿瘤的情况，若发现肿瘤生长迅速或出现疑似恶变的征象，可及时考虑手术等干预措施，有助于改善预后。
成年后：骨骼生长基本停止，肿瘤生长速度相对减慢。但此时如果肿瘤已经造成了一些不可逆的损害，如关节畸形等，可能会对患者的日常生活产生较大影响。不过，如果成年后肿瘤没有明显的进展或并发症，预后相对儿童时期可能相对稳定，但仍需要定期随访监测肿瘤的情况。
性别因素对预后的影响
总体影响不大：目前没有明确的证据表明性别差异会对遗传性多发性骨软骨瘤的预后产生显著不同的影响。无论是男性还是女性患者，其预后主要取决于肿瘤的生长情况、是否发生恶变以及是否出现并发症等因素。例如，在恶变概率方面，男性和女性患者并没有明显的性别差异，恶变后的预后也不会因性别而有本质不同。
生活方式对预后的影响
合理生活方式的积极作用：保持健康的生活方式对遗传性多发性骨软骨瘤患者的预后有一定的积极影响。适当的运动有助于维持骨骼和关节的功能，增强肌肉力量，减轻肿瘤可能导致的肢体活动受限等问题。例如，适度的游泳、散步等运动可以在一定程度上改善患者的关节功能，提高生活质量。同时，合理的饮食，保证营养均衡，有助于维持骨骼的健康状态，对整体预后有帮助。
不良生活方式的消极影响：不良的生活方式可能会加重病情的影响。例如，长期过度劳累、剧烈运动可能会加重肿瘤对周围组织的压迫，导致疼痛等症状加重。吸烟、酗酒等不良习惯可能会影响身体的整体健康状况，间接对肿瘤的预后产生不利影响，但目前关于吸烟、酗酒与遗传性多发性骨软骨瘤预后的具体关联机制还在进一步研究中，但已有一些研究提示不良生活方式可能会干扰身体的代谢和修复机制，对患者的康复和预后产生不良作用。
病史对预后的影响
既往治疗史的影响：如果患者既往已经接受过手术治疗，手术的效果以及术后恢复情况会影响预后。例如，手术切除是否彻底，术后是否出现感染、复发等情况。如果手术切除较为彻底，术后恢复良好，那么预后相对较好；如果术后出现复发，肿瘤再次生长，可能需要进一步的治疗，预后则会受到一定影响。
家族病史的影响：家族中有遗传性多发性骨软骨瘤患者的病史情况，可能提示患者的病情遗传背景较为明确。但家族病史本身并不是直接决定预后的唯一因素，而是通过影响患者的病情发展特点等间接起作用。例如，家族中多名成员患病且病情进展较快的患者，在临床监测和治疗决策上可能会更加谨慎，以争取更好的预后。
