停药后月经不来可能由多种因素导致，包括妊娠相关因素（有性生活未避孕需先排查怀孕）、内分泌紊乱（下丘脑-垂体-卵巢轴功能失调，受年龄、生活方式等影响）、疾病因素（多囊卵巢综合征患者停药后易因自身内分泌紊乱致月经不来，甲状腺疾病也可干扰内分泌引起月经异常）以及药物影响的个体差异（不同人对炔雌醇环丙孕酮代谢反应不同，年龄等因素致对停药后月经影响有差异）。
内分泌紊乱
下丘脑-垂体-卵巢轴功能失调：炔雌醇环丙孕酮是复方短效口服避孕药，其成分雌激素和孕激素会对下丘脑-垂体-卵巢轴产生调节作用。停药后，身体可能需要一定时间来重新建立自身的内分泌调节机制。如果自身内分泌调节机制未能及时恢复正常，可能导致下丘脑-垂体-卵巢轴功能失调，进而引起月经不来。不同年龄女性，如青春期女性下丘脑-垂体-卵巢轴尚不完善，育龄期女性因生活压力、作息不规律等可能影响该轴功能，围绝经期女性本身内分泌处于波动阶段，都可能因炔雌醇环丙孕酮停药影响此轴功能而出现月经不来情况。生活方式中长期熬夜、精神压力过大等会加重内分泌紊乱风险。
疾病因素
多囊卵巢综合征：本身患有多囊卵巢综合征的女性，在服用炔雌醇环丙孕酮停药后更易出现月经不来的情况。多囊卵巢综合征患者本身存在排卵障碍、内分泌失调等问题，炔雌醇环丙孕酮停药后其自身紊乱的内分泌状态难以快速调整，会持续影响月经周期。不同性别中女性患病时受影响，年龄上育龄期女性多见，生活方式中肥胖等因素会加重多囊卵巢综合征病情从而影响停药后月经情况，病史中多囊卵巢综合征病史是关键因素。
甲状腺疾病：甲状腺功能异常也可能导致停药后月经不来。甲状腺激素参与机体的代谢调节，甲状腺功能减退时，机体代谢减慢，可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，导致月经紊乱；甲状腺功能亢进时，机体处于高代谢状态，也会干扰内分泌平衡，引起月经异常。不同年龄、性别均可受甲状腺疾病影响，生活方式中碘摄入异常等可能与甲状腺疾病相关，进而影响停药后月经情况，病史中甲状腺疾病病史是重要因素。
药物影响的个体差异
不同个体对药物的代谢与反应不同：每个人的身体代谢情况存在差异，有些人对炔雌醇环丙孕酮的代谢速度较快，停药后身体内激素水平的变化不能按照预期恢复，从而导致月经不来。年龄较小的女性身体各器官功能尚未完全成熟，对药物的代谢和反应与成年人不同，更易因炔雌醇环丙孕酮停药出现月经不来情况；老年女性内分泌功能本身在衰退，对药物停药后的反应也有其特殊性。生活方式中个体的营养状况等也可能影响药物代谢从而影响月经情况。
