肛门闭锁的病因尚未完全明确，考虑是胚胎在4-8周时，尿生殖隔向泄殖腔移行受阻引起的，与遗传有关。
另外，妊娠早期受到病毒感染、妊娠期体内营养缺乏、周围环境污染、长期接触化学物质等因素，可增加孩子患肛门闭锁的风险。
如果患儿确诊为肛门闭锁，可以通过手术进行治疗，比如会阴肛门成形术、腹腔镜辅助下骶会阴直肠肛门成形术、后矢状入路肛门直肠成形术等。
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