功能性胃肠病即胃肠功能紊乱，胃肠功能紊乱的诊断方法是体格检查、影像学检查、实验室检查等。
1.体格检查
医生可以通过视诊、听诊、叩诊、触诊等检查，判断患者的胃肠功能，排除明显的器质性病变。
2.影像学检查
患者进行钡剂灌肠造影检查可以初步明确胃肠道黏膜病变;患者进行胃肠镜检查和胶囊内镜检查则可以排除消化道出血、消化性溃疡、胃肠肿瘤等器质性病变;患者进行排粪造影检查则可以在X线下动态观察患者直肠和肛门的形态及盆底肌的运动功能。
3.实验室检查
患者进行C-13或C14呼气试验检查可以明确功能性胃肠病是否与幽门螺杆菌感染有关;患者进行粪便常规检查和大便隐血试验时，能够明确患者是否存在细菌、寄生虫感染及消化道出血的情况。
