并不存在神经性头疼最好的药，治疗神经性头疼的常用药物为非甾体抗炎药、肌肉松弛剂、抗抑郁药、抗焦虑药等。
1.非甾体抗炎药
对乙酰氨基酚通过抑制前列腺素合成产生解热、镇痛作用，副作用相对较少，适用于轻至中度神经性头疼。布洛芬通过抑制环氧化酶活性，减少前列腺素合成，减轻炎症反应和疼痛，抗炎、解热、镇痛效果较好。阿司匹林同样抑制前列腺素合成，小剂量使用不良反应少，但大剂量或长期使用可能增加胃肠道不良反应风险。
2.肌肉松弛剂
乙哌立松能作用于脊髓和血管平滑肌，改善肌肉紧张状态，缓解因肌肉紧张引发的头疼，常用于紧张性头疼。氯唑沙宗主要作用于中枢神经系统，阻断疼痛反射弧，使痉挛肌肉松弛，减轻头疼。临床研究显示，使用肌肉松弛剂后，约50%-70%患者肌肉紧张及头疼症状得到改善。
3.抗抑郁药
阿米替林通过调节神经递质，如5-羟色胺和去甲肾上腺素水平，改善头疼症状，尤其适用于伴有抑郁、焦虑情绪的神经性头疼患者。度洛西汀对5-羟色胺和去甲肾上腺素的再摄取均有抑制作用，可缓解头疼并改善情绪障碍。使用抗抑郁药治疗神经性头疼，部分研究表明约60%患者头疼发作频率和程度有所降低。
4.抗焦虑药
地西泮具有抗焦虑、镇静催眠、抗惊厥及肌肉松弛作用，可缓解因焦虑引发的头疼。阿普唑仑抗焦虑作用较强，能快速减轻焦虑情绪导致的头疼症状。一般使用抗焦虑药后，约70%-80%患者焦虑相关头疼症状能较快缓解。
