女性月经不干净可能由多种原因引起，包括内分泌失调（青春期、围绝经期女性易出现，长期熬夜等生活方式可干扰）、子宫肌瘤（影响子宫收缩致月经异常）、子宫内膜炎（病原体感染致内膜充血水肿）、宫内节育器影响（放置后前几月常见）、全身性疾病（血液系统疾病影响凝血、甲状腺功能异常干扰内分泌）以及妊娠相关情况（先兆流产、宫外孕等），育龄女性有性生活且未避孕时出现月经不干净需先排除妊娠相关。
子宫肌瘤
原因：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，它可能会影响子宫的收缩，导致子宫内膜面积相对增大，进而引起月经血量增多、经期延长等月经不干净的表现。不同年龄的女性都可能患子宫肌瘤，生育期女性相对高发。对于有子宫肌瘤的女性，肌瘤的大小、位置等因素会影响月经情况，较大的肌壁间肌瘤或黏膜下肌瘤更易导致明显的月经异常。
子宫内膜炎
原因：子宫内膜发生炎症时，炎症刺激会使子宫内膜充血、水肿，影响其正常的修复和脱落过程，从而出现月经不干净的现象。各种原因引起的病原体感染都可能引发子宫内膜炎，比如产后、流产后感染，不注意经期卫生等。性生活活跃的育龄女性相对更易患子宫内膜炎，而有宫腔操作史（如刮宫、放置宫内节育器等）的女性感染风险也会增加。
宫内节育器影响
原因：宫内节育器作为一种避孕工具，可能会对子宫内膜产生局部的刺激，导致子宫内膜出现不规则脱落，表现为月经不干净。不同年龄使用宫内节育器的女性都可能出现这种情况，一般在放置宫内节育器后的前几个月比较常见，身体需要一定时间适应。随着时间推移，部分女性的适应情况不同，月经不干净的表现可能会有所变化。
全身性疾病
原因：一些全身性疾病也可能导致月经不干净，如血小板减少性紫癜等血液系统疾病，会影响凝血功能，导致月经期间出血不易停止；甲状腺功能异常，无论是甲状腺功能亢进还是减退，都可能干扰内分泌系统，进而影响月经。不同年龄的人群都可能因全身性疾病出现月经不干净，比如患有甲状腺疾病的育龄女性或围绝经期女性都可能受其影响。生活方式方面，长期营养不良等也可能影响身体整体状况，间接导致月经异常。
妊娠相关情况
原因：对于有性生活的女性，月经不干净还需要考虑妊娠相关情况，如先兆流产、宫外孕等。先兆流产时，胚胎与子宫壁之间可能出现剥离，导致阴道出血，常被误认为是月经不干净；宫外孕时，受精卵着床在子宫以外的部位，也会出现不规则阴道出血，易被混淆为月经问题。在育龄女性中，尤其是有正常性生活且未采取有效避孕措施的女性，出现月经不干净时应首先排除妊娠相关情况。
