输卵管异位妊娠最常见原因是输卵管炎症，包括输卵管黏膜炎（轻者致管腔变窄、纤毛功能受损，重者部分修复仍可致异位妊娠）和输卵管周围炎（致周围粘连、扭曲、管腔狭窄、蠕动减弱），此外输卵管发育不良或功能异常、手术史、辅助生殖技术、避孕失败、肌瘤或肿瘤压迫等也与之相关，有相关病史人群需积极处理降低风险、密切关注妊娠情况。
输卵管黏膜炎：轻者可使输卵管黏膜皱褶粘连，管腔变窄，或使纤毛功能受损，从而影响受精卵在输卵管内的正常运行，导致受精卵在局部着床发育。例如，淋菌及沙眼衣原体所致的输卵管炎常累及黏膜，严重者可引起输卵管管腔完全闭塞而导致不孕，但轻者经治疗后输卵管黏膜部分修复，仍可发生异位妊娠。
输卵管周围炎：多发生在输卵管的浆膜层或浆肌层，常造成输卵管周围粘连，输卵管扭曲，管腔狭窄，管壁肌蠕动减弱，影响受精卵的运行。如盆腔炎性疾病后遗症，可使输卵管与周围组织粘连，改变了输卵管的正常解剖结构和功能，增加了异位妊娠的发生风险。
此外，其他一些因素也与输卵管异位妊娠的发生相关，但输卵管炎症是最为主要的原因。比如，输卵管发育不良或功能异常，输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏等发育不良情况，会影响受精卵的正常运行；输卵管手术史，如输卵管绝育术后若形成输卵管再通或瘘管，均有导致输卵管异位妊娠的可能；辅助生殖技术，随着辅助生殖技术的应用，输卵管异位妊娠的发生率有所增加；避孕失败，如宫内节育器避孕失败时，发生输卵管异位妊娠的机会增大；子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫输卵管，影响输卵管管腔通畅，使受精卵运行受阻等。对于有输卵管炎症病史的女性，尤其是未生育且有备孕计划的女性，应积极治疗输卵管炎症，在备孕前进行相关检查评估输卵管情况，以降低输卵管异位妊娠的发生风险；对于有输卵管手术史、辅助生殖等高危因素的人群，也需要密切关注妊娠情况，早期发现异位妊娠并及时处理。
