巴戟天是临床常用的补益中药，具有补肾阳、强筋骨、祛风湿等核心功效，适用于肾阳不足所致腰膝酸软、阳痿遗精，及风湿痹痛、筋骨痿软等属肝肾不足兼风湿痹阻者的辅助调理。
巴戟天的有效成分（如蒽醌类、黄酮类化合物）可调节下丘脑-垂体-性腺轴，提高睾酮水平，改善男性性功能障碍；其活性成分能促进成骨细胞增殖分化，抑制破骨细胞活性，对骨质疏松、筋骨痿软等肾阳不足所致病症有辅助改善作用，临床常用于肾阳虚型骨质疏松症、骨关节炎等属肝肾不足兼风湿痹阻者。
现代药理研究表明，巴戟天具有抗炎镇痛作用，能抑制TNF-α、IL-6等炎症因子释放，减轻关节炎症反应；其含有的挥发油成分可缓解肌肉痉挛，对风湿性关节炎、类风湿性关节炎等属肝肾不足兼风湿痹阻者，临床常与杜仲、桑寄生、独活等配伍使用，增强祛风湿、强筋骨之效。
巴戟天能调节生殖内分泌，增强性腺功能，对男性阳痿、遗精及女性宫寒不孕等肾阳虚型病症有辅助调理效果；临床研究显示，巴戟天多糖可提高肾阳虚模型动物的睾酮、雌激素水平，改善生殖激素紊乱状态，对肾阳虚型不育症有一定辅助治疗作用，常配伍枸杞子、菟丝子等使用。
巴戟天性温助热，阴虚火旺（表现为口干舌燥、潮热盗汗、舌红少苔）者应禁用；孕妇、哺乳期妇女及高血压、糖尿病等慢性病患者需在医生指导下使用，避免与降压药、降糖药等联用；感冒发热期间不宜服用，过敏体质者慎用，服药期间应避免辛辣生冷饮食。
