中药蜈蚣具有毒性成分，其副作用包括过敏反应、神经毒性、消化系统刺激等，需严格遵医嘱使用并警惕特殊人群禁忌。
蜈蚣含异体蛋白及组胺类物质，过敏体质者内服或外用可能出现皮疹、瘙痒、呼吸困难，严重时伴喉头水肿。临床曾报道外用致接触性皮炎案例，内服需首剂小剂量观察，过敏史者禁用。
蜈蚣神经毒性成分对中枢及周围神经有影响，过量服用可致头晕头痛、肢体麻木、抽搐，严重时意识障碍。动物实验显示其提取物可影响神经递质传递，临床需严格控制剂量，避免久服。
蜈蚣性温味辛，过量服用刺激胃肠道，引发恶心呕吐、腹痛腹泻，甚至消化道出血。空腹服用反应更显著，建议饭后服用并从小剂量开始，脾胃虚寒者慎用。
孕妇因蜈蚣活血通经作用可能致流产，禁用；儿童肝肾功能未全，易蓄积中毒；肝肾功能不全者代谢力弱，毒性成分滞留增加肝肾负担，三类人群均需严格禁忌。
《中国药典》规定蜈蚣内服常用量1-3g/日，超量或与附子、肉桂等辛热药同服，可加重燥热反应；与镇静药同用可能拮抗药效，需单独辨证配伍，监测用药反应。
