金匮肾气丸有调节内分泌与代谢、改善肾脏功能、对心血管系统有影响、提高机体免疫力等功效作用，孕妇慎用，儿童一般不建议使用，老年人使用需谨慎，在医生指导下权衡。
改善肾脏功能：对于肾脏相关的一些病理状态可能有一定的改善作用。它可以通过增加肾血流量等途径，在一定程度上保护肾脏组织，减轻肾脏的损伤，对慢性肾病等可能有辅助的改善作用，但这需要在专业医生的指导下，结合具体病情来合理应用，不能替代正规的针对肾脏疾病的主要治疗措施。对于有肾脏基础疾病的患者，使用时更要谨慎评估病情和药物的相互作用等情况。
对心血管系统的影响：在心血管方面，金匮肾气丸可能有助于改善心肌的血液供应等。有研究发现它可能通过调节血管内皮功能等，对高血压、冠心病等心血管疾病相关的一些病理环节产生影响，比如可能在一定程度上减轻血管的痉挛、改善心肌的缺血状况等，但同样需要更多大规模、高质量的临床研究来进一步确切证实其在心血管疾病防治中的具体疗效及适用范围等。对于本身有心血管疾病的患者，使用金匮肾气丸时也需要密切监测心血管相关指标以及与其他心血管药物的相互作用等情况。
提高机体免疫力：从中医理论角度认为其有扶正固本的作用，可能在一定程度上有助于提高机体的免疫力，增强机体对外界致病因素的抵抗能力。例如，可能对机体的免疫细胞功能等有一定的调节作用，从而使机体在面对病毒、细菌等病原体侵袭时能有更好的应对能力，但现代医学对于其具体如何精准调节免疫细胞及相关免疫因子等方面还需要更深入探究来明确其科学的免疫调节机制及在不同免疫状态人群中的应用情况等。对于免疫力低下的人群，在考虑使用金匮肾气丸来辅助提高免疫力时，也需要结合自身整体健康状况等综合判断。
特殊人群方面，孕妇应慎用金匮肾气丸，因为其中一些成分可能对胎儿产生潜在影响，但具体情况还需根据个体的妊娠情况等由医生进行专业评估；儿童由于其身体处于生长发育阶段，脏器功能尚未完全成熟，目前并没有足够充分的临床证据表明金匮肾气丸对儿童是安全有效的，所以一般不建议低龄儿童使用金匮肾气丸；老年人使用时也需要更加谨慎，因为老年人各脏器功能有所减退，药物在体内的代谢、排泄等过程可能与年轻人不同，容易发生药物蓄积等情况，所以需要在医生的指导下，根据具体病情、肝肾功能等情况来权衡是否使用以及确定合适的用药方案等。
