酵素梅可能引发消化道不适刺激胃肠道致腹痛腹泻等、长期大量食用干扰消化酶分泌致营养吸收障碍、部分含较多糖分影响糖尿病患者血糖波动、个别人群可能过敏及过量食用可能加重肝肾功能不佳者病情。
一、消化道不适
酵素梅可能会刺激胃肠道，导致腹痛、腹泻等症状。例如，部分人群食用后可能出现肠道蠕动加快，从而引发腹泻，这是因为酵素梅中的成分可能影响肠道的正常消化吸收功能，对于一些胃肠道较为敏感的人群，如本身患有胃炎、肠炎的人，这种刺激可能更为明显。
二、营养吸收障碍
长期大量食用酵素梅可能干扰正常的消化酶分泌，影响食物中营养物质的吸收。比如，会影响蛋白质、脂肪、碳水化合物等的消化吸收过程，长此以往可能导致营养不良，尤其对于儿童、孕妇等对营养需求较高的人群，可能会影响其正常的生长发育或胎儿的健康发育。
三、血糖波动
有些酵素梅中可能添加了较多糖分，对于糖尿病患者来说，食用后会引起血糖的波动，不利于血糖的控制。因为糖尿病患者需要严格控制糖分摄入，而酵素梅中的糖分可能会使血糖在短时间内升高，增加并发症发生的风险。
四、过敏反应
个别人群可能对酵素梅中的某些成分过敏，出现皮疹、瘙痒、呼吸困难等过敏症状。过敏反应的发生与个体的过敏体质有关，一旦发生过敏，需要及时就医处理，对于儿童等过敏体质相对不稳定的人群，更应谨慎食用酵素梅，避免接触可能引起过敏的成分。
五、对肝肾功能的潜在影响
目前虽然没有明确的大规模研究表明酵素梅一定会对肝肾功能造成损害，但过量食用可能会加重肝、肾等器官的代谢负担。对于本身肝肾功能不佳的人群，如患有肝炎、肾炎的患者，这种额外的代谢负担可能会进一步加重病情，所以这类人群应避免随意食用酵素梅。
