正气丸和藿香正气丸有区别，体现在药物组成、功效主治不同，儿童、老年人等特殊人群使用时均需在医生严格指导下进行，医生会综合多因素判断是否适用及确定用药方案以确保安全。
藿香正气丸主要药物组成有广藿香、紫苏叶、白芷、白术（炒）、陈皮、半夏（制）、厚朴（姜制）、茯苓、桔梗、甘草、大腹皮、大枣、生姜等；正气丸的药物组成与藿香正气丸有差异，具体成分因不同制剂可能有所不同，但总体是在藿香正气丸基础上或其他组方思路进行调整。
功效主治有差异
藿香正气丸主要功效为解表化湿、理气和中，常用于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的感冒，症见头痛昏重、胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐泄泻；而正气丸由于组成不同，其功效主治会有所不同，可能在针对特定病因引起的相关病症上有其相对独特的作用，但总体也是围绕祛湿、理气、和中、解表等方面有所侧重不同。例如正气丸可能在某些特定寒湿或气滞等引发的不适症状缓解上有其特点，但具体需依据其准确组方来确定更精准的功效指向。
对于特殊人群，比如儿童，由于其身体机能尚未发育完全，在使用这两种药物时需格外谨慎。儿童属于特殊用药人群，其肝肾功能相对较弱，药物代谢能力与成人不同。在选择使用正气丸或藿香正气丸时，必须在医生的严格指导下进行，医生会根据儿童的具体病情、年龄、体重等多方面因素来综合判断是否适用以及确定合适的用药方案，以确保用药安全，避免因药物使用不当对儿童身体造成不良影响。老年人由于脏器功能逐渐衰退，也属于特殊人群，在使用这两种药物时同样需要医生评估，因为药物在老年人身上的代谢、疗效及可能出现的不良反应等情况与其他人群有所不同，医生会权衡利弊后决定是否选用以及如何使用正气丸或藿香正气丸。
