附子理中丸与人参健脾丸在药物组成、功能主治、适用人群、药理作用方面存在差异。附子理中丸由附子等组成，功在温中健脾，适用于脾胃虚寒有明显寒象及非阴虚火旺人群，有调节胃肠等药理作用；人参健脾丸由人参等组成，能健脾益气和胃止泻，适合脾胃虚弱以气虚为主及非实热证人群，有调节胃肠等药理作用。
人参健脾丸主要由人参、白术（麸炒）、茯苓、山药、陈皮、木香、砂仁、炙黄芪、当归、酸枣仁（炒）、远志（制）组成。人参、黄芪可补气，白术、茯苓、山药能健脾，陈皮、木香、砂仁等可理气和胃，当归能补血，酸枣仁、远志有安神作用。
功能主治方面
附子理中丸：具有温中健脾的功效，主要用于脾胃虚寒，脘腹冷痛，呕吐泄泻，手足不温等病症。其针对的是脾胃虚寒较甚，有明显寒象，如腹部冷痛、腹泻较严重且怕冷明显的情况。从中医病机角度看，是阳气不足，寒邪内侵脾胃，导致脾胃运化功能失常。
人参健脾丸：功效为健脾益气，和胃止泻。用于脾胃虚弱所致的饮食不化、脘闷嘈杂、恶心呕吐、腹痛便溏、不思饮食、体弱倦怠等。侧重脾胃虚弱，以气虚为主，兼有湿滞，表现为消化功能较弱，有食欲不振、大便溏泄、身体倦怠等症状，其病理基础是脾胃气弱，运化失司，兼有一定的湿邪影响。
适用人群差异
附子理中丸：适用于年龄较大，体质偏虚寒，有明显脾胃寒证表现的人群。比如中老年患者，平时怕冷，冬季容易出现脾胃不适，吃凉东西后容易腹痛腹泻等情况。但对于阴虚火旺的人群不适用，因为其药物组成偏温燥，阴虚火旺者服用可能会加重体内虚火，出现口干、咽痛等症状。
人参健脾丸：适合脾胃虚弱，以气虚为主的各年龄段人群，但儿童需谨慎使用。对于一些长期饮食不规律，导致脾胃功能逐渐减弱，出现倦怠乏力、食欲不振的人群较为适用。而对于实热证患者不适合，实热证患者多表现为大便干结、口臭、舌苔黄厚等，服用人参健脾丸可能会助热，加重病情。
药理作用差异
附子理中丸：药理研究表明，它具有调节胃肠道运动、改善消化功能、增强免疫功能、抗溃疡等作用。其温阳散寒健脾的作用是通过多靶点来实现的，比如对胃肠道的运动有调节作用，能使胃肠蠕动恢复正常，对于寒邪导致的胃肠功能紊乱有改善作用。
人参健脾丸：药理上主要体现为调节胃肠功能、促进消化吸收、增强机体免疫功能等。通过其中的补气健脾药物，能增强脾胃的运化能力，促进食物的消化和营养的吸收，对于脾胃虚弱引起的消化功能障碍有改善作用，同时其补益成分有助于提高机体的免疫功能。
