碳13与碳14呼气试验均用于检测幽门螺杆菌，碳13无放射性适用于特殊人群，碳14有放射性对特殊人群需谨慎，二者检测准确性都较好，适用人群各有特点。
碳14呼气试验：利用的是具有放射性的碳-14，受检者口服含有碳-14标记的尿素，同样是基于幽门螺杆菌产生的尿素酶可分解尿素的原理，分解产生的含碳-14的二氧化碳经呼气排出，通过检测呼出气体中碳-14的量来确定是否有幽门螺杆菌感染。
辐射剂量方面
碳13呼气试验：碳13是稳定同位素，没有放射性，对人体几乎没有辐射危害，适用于包括孕妇、儿童等特殊人群，因为其安全性高，不会对人体造成辐射损伤。
碳14呼气试验：碳14具有放射性，虽然辐射剂量非常小，单次检查所接受的辐射剂量远低于对人体产生危害的剂量，但对于孕妇、哺乳期女性、儿童等特殊人群还是需要谨慎考虑，尤其是孕妇，为了避免可能存在的潜在辐射风险，一般不首选碳14呼气试验。
检测准确性方面
碳13呼气试验：准确性较高，在合适的操作规范下，其检测幽门螺杆菌的灵敏度和特异度都能达到较好水平，能够较为准确地诊断幽门螺杆菌感染情况。
碳14呼气试验：准确性也不错，同样在规范操作下能较好地检测幽门螺杆菌感染，但由于碳14有放射性，在一些对辐射更敏感或有特殊防护要求的情况下，可能会影响其应用的广泛性，不过在一般人群的常规检测中，其准确性是能够满足临床需求的。
适用人群方面
碳13呼气试验：由于无辐射，适用于多种人群，如儿童，因为儿童对辐射更敏感，碳13呼气试验更安全；孕妇，为避免放射性物质可能对胎儿产生潜在影响，碳13是更合适的选择；还有老年人、体质较弱者等，都可以放心进行碳13呼气试验来检测幽门螺杆菌。
碳14呼气试验：一般适用于非特殊人群的幽门螺杆菌检测，但对于孕妇、哺乳期女性、儿童等，需要权衡利弊后谨慎选择，通常在非特殊情况且患者无特殊禁忌时可进行碳14呼气试验。
